Hầu hết các công ty nghĩ đến việc mua một phần mềm kế toán ngay khi bắt đầu thành lập. Bạn có thể dang có một doanh nghiệp nhỏ cần được tổ chức tốt hơn hay vừa thành lập một doanh nghiệp mới làm dịch vụ web. Dù lý do gì đi nữa, bạn sẽ có rất nhiều sự lựa chọn về phần mềm kế toán.

Một số phần mềm kế toán phù hợp với các doanh nghiệp lớn, phức tạp, có nhu cầu quản trị tài chính. Những phần mềm này thông thường có nhiều chức năng hơn các sản phẩm phần mềm kế toán cơ bản. Nhưng phần mềm kế toán cơ bản thường chỉ có các chức năng quản lý tiền, phải thu, phải trả, sổ cái và vật tư. Tuy nhiên với các phần mềm kế toán cao cấp hơn, bạn có thể nhận được các chức năng:

• Tài sản cố định
• Quản lý mua sắm
• Quản lý chuyển hàng và nhận hàng
• Quản trị dịch vụ
• Thị trường
• Kinh doanh qua mạng
• Tiền lương
• Quản trị khách hàng
  

Hầu hết các phần mềm kế toán đều có khả năng tích hợp các thành phần đề cung cấp thông tin kế toán đầy đủ. Tuy nhiên bạn cũng nên mua các phần mềm có tính linh động cao, dễ thay đổi và bổ sung. Như thế, bạn có thể tùy biến sản phẩm phần mềm kế toán để phù hợp hơn với doanh nghịêp của bạn. Thông thường ngay cả các phần mềm kế toán cơ bản cũng có vài tính năng có thể được j tùy  biến, nhưng thông thường chỉ ở mức đơn giản và chỉ ở vài chức năng.

Tùy vào mô hình doanh nghiệp của bạn, bạn có thể cần một phần mềm kế toán cho phép có nhiều người sử dụng đồng thời, có khả năng phân quyền đầy đủ và chi tiết, đồng thời có thể kiểm soát việc cập nhật và thay đổi dữ liệu của từng người.